Peptidlardan foydalanganda biz ko'pincha peptidlarning tozaligi va peptid tarkibining ko'rsatkichlariga duch kelamiz. Ko'p odamlar nima uchun peptidlarning tozaligi 95%, ammo peptid miqdori atigi 80% deb hayron bo'lishi mumkin. Buning sababi shundaki, bu ikki xil tushunchalar.
Peptid tozaligi: Peptid tozaligi HPLC tahlili yordamida 214 nm (214 nm - peptid zanjirining yutilish to'lqin uzunligi) da aniqlangan maqsadli peptid miqdorini bildiradi.
Peptid tarkibi: Bu namunadagi peptid bo'lmagan moddalarga nisbatan-peptidlar foizini bildiradi.
Peptidning tozaligi HPLC tomonidan 214 nm (214 nm - peptid zanjirining yutilish to'lqin uzunligi) da aniqlangan maqsadli peptid tarkibiga ishora qiladi. Maqsadli peptiddan tashqari, HPLC aralashmalarni ham aniqlay oladi, jumladan: o'chirilgan ketma-ketliklar (bir yoki bir nechta aminokislota qoldiqlari mavjud bo'lmagan maqsadli ketma-ketliklar), kesilgan ketma-ketliklar (himoya paytida hosil bo'lgan ketma-ketliklar) va to'liq himoyalanmagan ketma-ketliklar (natijada sintez jarayoni yoki yakuniy parchalanish jarayoni). Biroq, HPLC suv va trifloroatsetat (TFA) va asetat kabi qoldiq tuzlarni aniqlay olmaydi. Peptid sintezi jarayonida peptidlar ketma-ketligi TFA yordamida qatrondan ajraladi va tozalash jarayonida oz miqdorda TFA ham hosil bo'ladi. Shuning uchun, Arg, Lys va His kabi peptidning erkin amino terminali va boshqa yon zanjirlari oz miqdorda TFA aralashmalarini hosil qilishi mumkin. Yana bir muammo - namlik. Peptidlar odatda liyofilizatsiya yordamida suvsizlanadi, ammo shunga qaramay, suv kovalent bog'lanish qobiliyatiga qarab har xil darajada mavjud bo'ladi. Shuning uchun etkazib beriladigan peptidlar odatda HPLC tomonidan aniqlanmaydigan TFA tuzlari va iz miqdordagi suvni o'z ichiga oladi, bu esa peptid tarkibi va tozaligidagi farqlarga olib keladi.
